Community Phylogenetics: linking community ecology and evolutionary biology to your programming skills

par | by Pedro Henrique P. Braga (Concordia University) & Katherine Hébert (Université de Sherbrooke)

Comment les espèces s’assemblent-elles dans les communautés ? Quels sont les mécanismes impliqués ? Ces questions ont fasciné des écologistes pendant des décennies! L’assemblage d’organismes dans les communautés écologiques dépendent de phénomènes historiques et écologiques. Il est donc nécessaire de relier et de tester des hypothèses évolutives et écologiques pour répondre à ces questions. En combinant les informations phylogénétiques avec la coexistence géographique des espèces, le champ de « phylogénie des communautés » est apparu afin de révéler les patrons et les processus menant à l’organisation et à la structure des communautés écologiques. Dans cet atelier, nous allons plonger dans les débats et les controverses entourant la structure des communautés et apprendre certaines des méthodes utilisées par la phylogénétique de la communauté pour détecter les patrons évolutives lors de l’assemblage des communautés des espèces.

How do species assemble in communities? What are the involved mechanisms? These questions have fascinated ecologists for decades. As the community assembly of organisms depends on historical and ecological phenomena, it is necessary to link evolutionary and ecological hypotheses testing to address these questions. By combining phylogenetic information and species geographical co-existence, ‘community phylogenetics’ emerged as field seeking to reveal patterns and processes driving the organization and structure of ecological communities. In this workshop, we will dive into the debates and controversies surrounding the community structure and learn some of the various approaches used by community phylogenetics to detect evolutionary patterns on community assembly.

Preamble

We developed this workshop and self-guided tutorial to help researchers acquire a short background on phylogenetic patterns of community structure.

It was originally instructed during the 3rd QCBS R Symposium, which happened between October 10th and 12th, 2019, at the Gault Nature Reserve (McGill University), in Mont-Saint-Hilaire, QC (Canada).

Part of the material was inspired in the content of the book Phylogenies in Ecology, by Marc W. Cadotte and Jonathan Davies (2016).

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Kind regards,

Pedro Henrique P. Braga and Katherine Hébert
pedrohbraga.github.io | github.com/katherinehebert
ph.pereirabraga [at] gmail [dot] com | katherine.ahebert [at] gmail [dot] com

Access the workshop

https://pedrohbraga.github.io/CommunityPhylogenetics-Workshop/CommunityPhylogenetics-Workshop.html